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電子發(fā)燒友網(wǎng)>電子資料下載>電子論文>數(shù)字信號處理論文>DNA片段拼接中的預歸并重復序列屏蔽方法

DNA片段拼接中的預歸并重復序列屏蔽方法

2009-03-21 | rar | 191 | 次下載 | 5積分

資料介紹

針對DNA 片段拼接中的重復序列識別及屏蔽問題,提出一種預歸并重復序列屏蔽方法。在片段拼接前通過掃描子串標識出可能存在重疊關系的shotgun 片段,利用子串歸并該相關片段,標識出重復序列的位置信息,達到屏蔽的目的。計算機模擬分析表明,該方法識別重復序列的錯誤率低,通過預歸并有效縮減了shotgun 集合的規(guī)模,降低了拼接時的計算復雜度。
關鍵詞:片段拼接;預歸并;重復序列;屏蔽
DNA
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